單細(xì)胞基因組學(xué),表觀基因組學(xué),轉(zhuǎn)錄組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)研究揭示出了即使是在同一組織中遺傳相同的細(xì)胞之間,基因和蛋白質(zhì)表達(dá)依然存在差異。但是來自美國Parker癌癥免疫療法研究所的生物學(xué)家Pier Federico Gherardini指出,目前大多數(shù)此類研究只檢查了每個(gè)細(xì)胞的單層信息,這可能會(huì)產(chǎn)生偏差?,F(xiàn)階段,科學(xué)家們已經(jīng)開始以單細(xì)胞分辨率組合多層信息。這些“多組學(xué)”技術(shù)可以更仔細(xì)地觀察細(xì)胞之間的可變性,更清楚地識(shí)別特定細(xì)胞及其功能。分析基因組DNA揭示了單細(xì)胞基因組,甲基化組織或染色質(zhì),單細(xì)胞Trio-seq同時(shí)檢測(cè)同一個(gè)細(xì)胞內(nèi)的轉(zhuǎn)錄組和基因組或者表觀組的狀態(tài),系統(tǒng)研究基因組,表觀修飾和基因表達(dá)的關(guān)系。而分析RNA和蛋白質(zhì)則能分別產(chǎn)生轉(zhuǎn)錄組和蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù)。
HepG2(人肝母細(xì)胞瘤細(xì)胞G2期) scTrio-seq數(shù)據(jù)和HepG2 scRRBS數(shù)據(jù)中DNA片段的檢出率比較。
結(jié)果顯示大量細(xì)胞HepG2 RRBS數(shù)據(jù)中檢測(cè)到DNA片段在scTrio-seq數(shù)據(jù)中均有檢測(cè)到。
大量細(xì)胞樣本gDNA測(cè)序與單細(xì)胞scTrio-seq數(shù)據(jù)結(jié)果所檢測(cè)到的DNA拷貝數(shù)變異(CNV)比較
不同的細(xì)胞個(gè)數(shù)scTrio-seq與大量細(xì)胞測(cè)序檢測(cè)到的基因數(shù)量比較
甲基化和基因組不能同時(shí)做,但是甲基化的結(jié)果也可以評(píng)估基因組上的拷貝數(shù)變異。