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單細(xì)胞多組學(xué)測(cè)序(scTrio-seq)

產(chǎn)品介紹

       單細(xì)胞基因組學(xué),表觀基因組學(xué),轉(zhuǎn)錄組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)研究揭示出了即使是在同一組織中遺傳相同的細(xì)胞之間,基因和蛋白質(zhì)表達(dá)依然存在差異。但是來自美國Parker癌癥免疫療法研究所的生物學(xué)家Pier Federico Gherardini指出,目前大多數(shù)此類研究只檢查了每個(gè)細(xì)胞的單層信息,這可能會(huì)產(chǎn)生偏差?,F(xiàn)階段,科學(xué)家們已經(jīng)開始以單細(xì)胞分辨率組合多層信息。這些“多組學(xué)”技術(shù)可以更仔細(xì)地觀察細(xì)胞之間的可變性,更清楚地識(shí)別特定細(xì)胞及其功能。分析基因組DNA揭示了單細(xì)胞基因組,甲基化組織或染色質(zhì),單細(xì)胞Trio-seq同時(shí)檢測(cè)同一個(gè)細(xì)胞內(nèi)的轉(zhuǎn)錄組和基因組或者表觀組的狀態(tài),系統(tǒng)研究基因組,表觀修飾和基因表達(dá)的關(guān)系。而分析RNA和蛋白質(zhì)則能分別產(chǎn)生轉(zhuǎn)錄組和蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù)。

技術(shù)流程

部分結(jié)果展示


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HepG2(人肝母細(xì)胞瘤細(xì)胞G2期) scTrio-seq數(shù)據(jù)和HepG2 scRRBS數(shù)據(jù)中DNA片段的檢出率比較。

結(jié)果顯示大量細(xì)胞HepG2 RRBS數(shù)據(jù)中檢測(cè)到DNA片段在scTrio-seq數(shù)據(jù)中均有檢測(cè)到。





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大量細(xì)胞樣本gDNA測(cè)序與單細(xì)胞scTrio-seq數(shù)據(jù)結(jié)果所檢測(cè)到的DNA拷貝數(shù)變異(CNV)比較



圖片12.png

不同的細(xì)胞個(gè)數(shù)scTrio-seq與大量細(xì)胞測(cè)序檢測(cè)到的基因數(shù)量比較



送樣要求

一、
從組織分離單細(xì)胞,要求是新鮮的組織,沒有經(jīng)過冷凍、固定等處理。
二、
保證細(xì)胞活性和形態(tài)完整,不要損傷細(xì)胞。
三、
分離的單細(xì)胞放入公司提供的裂解液中,使用200μl的PCR管,每管裂解液用量為4μl,放入細(xì)胞時(shí)帶入緩沖液體積不要超過1μl。
四、
細(xì)胞數(shù)量:每孔放入一個(gè)或多個(gè)細(xì)胞,每種細(xì)胞建議取3-5個(gè)細(xì)胞做重復(fù)。
五、
單細(xì)胞放入裂解液后,-80℃保存,干冰運(yùn)輸。運(yùn)輸?shù)臅r(shí)候要將管子做好包裝,放入干冰中,以防運(yùn)輸過程中管子損壞。
六、
裂解液-80℃保存,避免反復(fù)凍融。
七、
操作過程盡量保持低溫環(huán)境,加入單細(xì)胞的裂解液盡快放入-80℃保存,最好不要超過1小時(shí),中間的時(shí)間越短越好。
八、
樣本一旦放在-80℃或干冰凍存之后,不能反復(fù)化凍。

常見問題

單細(xì)胞多組學(xué)scTrio-seq可以同時(shí)測(cè)轉(zhuǎn)錄組、基因組和甲基化嗎?

甲基化和基因組不能同時(shí)做,但是甲基化的結(jié)果也可以評(píng)估基因組上的拷貝數(shù)變異。